Hiện nay đang trong giai đoạn giao mùa, lượng oxy, pH và kiềm trong môi trường có thấp so với bình thường. Ngoài ra các công trình thủy lợi – thủy điện đầu nguồn sông Bồ và sông Hương chuyển sang chế độ vận hành hồ chứa trong mùa cạn. Trong giai đoạn này các hồ chứa vận hành với lưu lượng đủ để sản xuất nông nghiệp,  đảm bảo môi trường nuôi trồng thủy sản vùng đầm phá; đảm bảo dòng chảy môi trường và trữ nước để phục vụ sản xuất vụ hè thu.  

Ngày 5-6/4/2017, trên sông Bồ địa bàn huyện Quảng Điền và thị xã Hương Trà đã có cá nuôi lồng chết ước khoảng gần 1.000 lồng, tỷ lệ chết từ 5 - 45% trên mỗi lồng do thiếu oxy (3-3,5mg/l), pH thấp (4,5-6,5), nước không lưu thông, cá có hiện tượng đỏ thân (dấu hiệu bệnh đốm đỏ).  Ngày 11/4/2017, Sở Nông nghiệp và PTNT tỉnh có Công văn số 458/SNNPTNT-CCTS về Tăng cường các biện pháp trong nuôi cá lồng, bè vào thời điểm giao mùa